البحث الهرمي الافتراضي عن مثبطات إنزيم البروتياز الرئيسي لفيروس كوفيد-19: البحث عن التشابه ونمذجة الفارماكوفور ودراسة الإرساء الجزيئي
- 24 Aug 2024
- الأبحاث المنشورة مؤخراً باسم الجامعة - الصيدلة
| الباحثون المشاركون | د. هدى مندو – د. إياد اللوص |
| منشور في | Anti-Infective Agents, volume 22, issue 4, article ID e310124226577, January 2024. |
| الملخص | الخلفية: أدى تفشي مرض كوفيد-19 الناجم عن فيروس كورونا 2 المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة (SARS-CoV-2) إلى انتشار الوباء على نطاق واسع. تضمنت الأساليب المختلفة إعادة تحديد موضع العلاجات المضادة للفيروسات والأدوية الأخرى. تمثل العديد من العلاجات، بما في ذلك العلاجات المضادة للفيروسات عن طريق الفم، بعض الأساليب للتكيف مع الوجود الطويل لجائحة كوفيد-19. توفر الدراسات الحاسوبية رؤى قيمة خلال اكتشاف الأدوية وتطويرها بما يتوافق مع الجهود العالمية للتغلب على الوباء. إنزيم البروتياز الرئيسي هو هدف أساسي في الدورة الفيروسية. يعمل تصميم الأدوية بمساعدة الكمبيوتر على تسريع تحديد العلاجات المحتملة، بما في ذلك العلاج عن طريق الفم. الأهداف: يهدف هذا العمل إلى تحديد مثبطات الأنزيم البروتيني الرئيسية المحتملة لـ SARS-CoV-2 باستخدام جوانب مختلفة من الأدوات الحاسوبية. الطرق: في هذا العمل، أجرينا مسحاً افتراضياً هرمياً لمثبطات إنزيم البروتياز الرئيسي لـ SARS-CoV-2. تم إجراء بحث تشابه لفحص جزيئات مشابهة للمثبط PF-07321332. في الوقت نفسه، تم اشتقاق الفارماكوفور القائم على البنية، إلى جانب الفارماكوفور اعتماداً على اللجين. تقوم مرشحة الخواص الدوائية بتصفية المركبات التي تم استردادها من بحث التشابه ونمذجة الفارماكوفور قبل إخضاعها للإرساء الجزيئي. تمت تصفية الجزيئات المرشحة التي أظهرت إلفة أعلى للبروتياز الرئيسي مقارنة بالمثبط المرجعي من خلال باراميترات الامتصاص والتوزيع والاستقلاب والإطراح (ADME). النتائج: وفقاً لتحليل إلفة الارتباط وتحليل ADME، تم إعطاء الأولوية لأربعة جزيئات (CHEMBL218022، PubChem163362029، PubChem166149100، وPubChem 162396459) باعتبارها نتائج واعدة. لم يتم الإبلاغ عن المركبات المذكورة أعلاه من قبل؛ ولا توجد دراسات تجريبية سابقة ومقايسات نشطة بيولوجياً متاحة لها. الاستنتاج: يمثل نهجنا في توفير الوقت استراتيجية لاكتشاف مثبطات إنزيم البروتياز الرئيسي الجديد لـ SARS-CoV-2. يمكن ترشيح النتائج النهائية لتكون رائدة في اكتشاف مثبطات جديدة لإنزيم البروتياز الرئيسي لـ SARS-CoV-2. الكلمات المفتاحية: الفارماكوفور، الإرساء، التشابه الدوائي، ADME، المسح الافتراضي، SARs-CoV-2. |
| رابط ملخص البحث |
